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一篇文章看懂:非经典样本核酸提取 × QIAGEN解决方案

时间:2026年08月05日信息来源:本站原创点击:



非经典样本系列已经从初春走到了盛夏,在这期间我们给大家带来了一系列从采集稳定→样本破碎→核酸提取的解决方案和相关建议,一经推出受到了大家的一致好评,今天我们将带您逐一盘点那些“难搞”的样本类型和对应的破局利器。


采集与核酸稳定:稳住样本,才是稳住实验的第一步

非经典

很多样本的“翻车”,从采集那一刻就开始了。核酸酶(尤其是RNase)无处不在,能在极短时间内将核酸分子切割降解。稳住样本,才是稳住实验的第一步。



富含RNase的样本:胰腺——RNase的“重灾区”

胰腺RNase浓度远高于其他器官,组织离体后迅速释放并降解RNA。

解决方案: 组织离体后立即浸入RNAprotect Tissue Reagent(≤100 mg为佳),研究对比发现,未经保护的胰腺组织直接-80°C冷冻,RIN平均值仅5.9,使用保护液后提升至8.7。如需同时稳定DNA、RNA和蛋白质,可选择Allprotect Tissue Reagent。

👉详情可点击:非经典样本核酸提取专场|第一步就赢麻!



血液与体液:量微易碎,抢时稳存

血液离体后,RNA表达谱在几分钟内发生显著变化。血浆/血清中的游离核酸,既少又脆弱,若发生了红细胞的破裂,释放出gDNA,会严重干扰其中游离核酸的检测。尿液样本量大、核酸少、细菌多,核酸更容易降解。

解决方案:

全血RNA:采血后立即提取,或使用PAXgene Blood RNA Tube采集稳定,配套PAXgene Blood RNA Kit提取。

血浆游离核酸:1小时内完成血浆分离冻存,或使用PAXgene Blood ccfDNA Tube(25°C保存10天,37°C保存3天)。

尿液:采样后立即提取,或使用PAXgene Urine Liquid Biopsy Set & Tube实现尿液的采集和储存。

👉详情可点击:体液样本核酸提取避坑,稳住样本才是关键



野外/常温场景:FTA卡——“六边形战士”

这张经化学浸渍处理的卡片,能在接触样本瞬间裂解细胞、灭活病原体(含核酸酶),并将DNA/RNA牢牢吸附在纤维素基质上,室温下可稳定保存数年至二十年。应用场景已从传统的法医STR分型、遗传病筛查扩展到植物、海洋哺乳动物、发酵食品、昆虫媒介等非经典样本领域。

👉详情可点击:FTA卡:样本采集与保存领域的“六边形战士”

样本破碎:确保均质与释放的第一步

非经典

样本破碎是整个核酸提取流程的“第一道防线”。面对骨骼、软骨、种子、木材这些“硬骨头”,没有强大的破碎手段,再好的提取试剂也无用武之地。

TissueLyser系列凭借珠磨研磨技术,配合不同规格的研磨珠,可适配从软质果蔬到极硬种子的各类样本。对于难以破碎的样品,建议结合液氮冷冻后研磨,不仅能最大限度地破坏细胞壁,还能防止DNA在破碎过程中被内源性核酸酶降解。


核酸提取:每种样本都有自己的脾气

非经典


脂肪与纤维组织:RNeasy Fibrous/Lipid Kits

纤维组织中收缩蛋白和胶原蛋白占干重90%以上,常规裂解液难以渗透;脂肪组织中脂滴占细胞体积90%以上,脂质在纯化过程中干扰硅胶膜结合效率。

DNA提取: DNeasy Blood & Tissue Kit从骨骼肌和皮下脂肪中提取的DNA产量最高,A260/A280比值均在1.8-2.0范围内。脂肪组织需过夜裂解后高速离心去除上层脂质层。

RNA提取:富含纤维样本推荐RNeasy Fibrous Tissue Mini Kit,富含脂肪样本推荐RNeasy Lipid Tissue Mini Kit。样本采集时,脂肪组织需用Allprotect Tissue Reagent(而非常规RNAprotect)进行核酸保护。

👉详情可点击:脂肪太油、纤维太韧?核酸提取不再“卡壳”



骨组织:“软骨”“致密骨”“古骨”三类不同处理方法

软骨DNA提取推荐液氮或TissueLyser研磨粉碎,56°C过夜蛋白酶K消化。RNA提取方面,RNeasy Fibrous Tissue Mini Kit适用于关节软骨、髓核、纤维环;RNeasy Lipid Tissue Mini Kit适用于半月板(脂质含量高)。

成熟/致密骨的DNA提取≤100 mg小样本直接裂解,>100 mg建议EDTA 37°C脱钙3-5天。骨组织RNA提取的关键是始终维持接近冷冻的温度条件下进行研磨破碎,以防RNA降解,并尽可能减少样本转移步骤,后续使用RNeasy Kits进行RNA提取。

陈旧骨/古骨:DNA高度片段化(常见<50 bp),需特殊短片段回收方案- MinElute PCR Purification Kit。

👉详情可点击:硬“骨”头也能轻松啃



木材:DNeasy Plant系列

木材细胞壁高度木质化,心材富含酚类、树脂、单宁,常规裂解液难以渗透。使用DNeasy Plant Mini Kit进行木材类DNA提取时,在裂解步骤中加入蛋白酶K并将65°C孵育延长至3小时,长片段PCR成功率从23.3%提升至83.3%。对于更“顽固”的木材,DNeasy Plant Pro Kit效果更佳。

👉详情可点击:“木”有DNA?有......还是木有?



深加工食品:DNeasy mericon Food Kit

罐头、果酱、熟肉等深加工食品,DNA已严重断裂至100–200 bp的超短片段,DNeasy mericon Food Kit通过优化结合缓冲液比例,调整QIAquick离心柱对短片段DNA的结合能力,显著提高回收效率。

👉详情可点击:食品DNA的“破碎”与“重生”



海洋生物:DNeasy PowerBiofilm Kit/RNeasy PowerPlant Mini Kit

珊瑚是“动物宿主+共生藻+寄生虫”的三重体系,表面覆盖厚厚黏液,骨骼含碳酸钙。DNeasy PowerBiofilm Kit专门针对珊瑚等黏稠样本优化——65°C加热激活裂解5分钟,有效溶解黏液中的多糖和蛋白质;特有的抑制物去除技术(IRT)仅需2-8°C孵育5分钟,即可去除多糖、多酚及腐殖酸等抑制剂。RNA提取方面建议使用RNeasy PowerPlant Mini Kit,配备研磨珠管,结合IRT抑制剂去除技术和特有PS缓冲液,在裂解阶段即主动清除抑制剂。

👉详情可点击:极端气候下的海洋困局

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点击此处查看QIAGEN“非经典”样本研究方

以上是QIAGEN“非经典样本系列”基于已发布文章所覆盖的样本类型和解决方案的梳理。但实验室里的“非经典”远不止这些:皮肤、毛发、指甲、昆虫、微生物拭子、痕量DNA……每一种“难搞”的样本,都可能藏着你苦苦追寻的生物学真相。


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